6 Kasım YÖK’ün kuruluş yıldönümü nedeniyle açıklama yapan Yılmaz, “Üniversiteler, 12 Eylül askeri rejiminin bir ürünü olan YÖK cenderesi altında. Türkiye’nin en karanlık dönemi olan 12 Eylül’de, YÖK eliyle üniversitelerdeki akademik, demokratik ve bilimsel ortam yok edilmiş, askeri bir disiplin uygulanmaya başlanmıştır. Özerk kuruluşlar olması gereken üniversitelerin bu özelliğinin ortadan kaldırılması, siyasal iktidarların ideolojik, politik ve kadrosal düzeyde tahakküm kurma girişimlerini kolaylaştırmıştır. YÖK son derece merkezi ve otoriter bir anlayışla yönetilmektedir. Eğitim Sen, YÖK’ün kaldırılması, üniversitelere idari ve bilimsel özerkliğin tanınması, üniversitelerin çağın, eğitim biliminin gereklerine uygun bir zeminde yeniden yapılandırılmasını istiyor” dedi.
Türkiye’nin demokratikleşme sancılan yaşadığı süreçte, demokratikleşme için ilk adımın üniversitelerde atılmasını, kurulduğu günden bu yana meşruluğu tartışılan YÖK’ün kaldırılmasını istediklerini ifade eden Yılmaz, başta öğretim üyeleri ve öğrenciler olmak üzere pek çok toplumsal kesimin içine sindiremediği bu kurumun 20 yıla aşkın zamandır doğurduğu sonuçların geçersiz olmasını açıkladı.